PhyloCoco: il freeware per gestire l'inferenza filogenetica
di Redazione | 17-6-2008
Il Mac è uno degli strumenti preferiti dai ricercatori di Biologia molecolare e Bioinformatica sia per le capacità di calcolo che per la facile portabilità di tanti strumenti di calcolo sulla piattaforma. Nasce a Bruxelles ma da un ricercatore italiano uno strumento interessante che rende più facile l'analisi di dataset molecolari nell'inferenza filogenetica.
Daniele Catanzaro è un dottorando della sezione Grafi e Ottimizzazione Matematica (G.O.M.) dell'Universita' Libera di Bruxelles (U.L.B.) e ci segnala la recente disponibilita' della versione 2.2 di PhyloCoco, un software per l'inferenza filogenetica.
L'inferenza filogenetica molecolare e' il problema piu' antico della bioinformatica e attualmente uno dei piu importanti.
Esso consiste nel generare un albero rappresentate le relazioni evolutive di un insieme di organismi a partire dalla conoscenza delle loro sequenze molecolari (tipicamente sequenze di DNA o proteiche).
I campi di applicazione vanno dalla ricerca medica (immunologia, trapianti d'organo) alla epidemiologia, dalla farmacologia, alla dinamica delle popolazioni.
PhyloCoco e' una piccolo front-end cocoa ad un insieme di complessi strumenti di ottimizzazione da linea di comando. Il suo scopo e' quello di automatizzare e rendere piu' intuitiva l'analisi di grandi dataset molecolari.
Il software e' free e scaricabile a questo indirizzo.
Per l'esecuzione è sufficiente un Mac con processore G4 o con Processore Intel Core Duo processor; Mac OS 10.4 o superiore, Java 1.4 o superiore. Si raccomanda un intel core 2 duo; Mac OS 10.5.3 o superiore, Java 1.5 o superiore.
Categorie: Freeware, Scienze e Matematica, Software / Mac App Store, Sci - Bio - Ing
Macity - Top News
- Live Score Addicts: tutto il calcio con video e notifiche in tempo reale su iPhone
- Pages Templates: 783 modelli già pronti per Pages con il 40% di sconto
- Applicazioni iPhone e Universal da pagamento a gratis: ecco le nostre scelte
- L'Aeronautica Militare USA potrebbe comprare fino a 18mila iPad
- L'oscar della musica consegnato alla memoria di Steve Jobs
- Google TV, un importante annuncio in arrivo domani?
- iPad 2, calano le scorte presso i distributori: iPad 3 all'orizzonte?
- Sony potrebbe in futuro portare il suo Vita OS su smartphone e tablet
- Corso di Dizione per iPhone e iPad
- The Darkness II per Mac arriva a marzo
AggiornaMac - Top News
- Pages Templates: 783 modelli già pronti per Pages con il 40% di sconto
- 200 euro di sconto su FileMaker Pro per chi acquista FileMaker Go per iPhone o iPad
- Gemini: la nuova utility per scovare ed eliminare tutti i duplicati su Mac
- Unstopabble Gorg: originale tower defense in stile fantascienza anni '50 per Mac e iPad
- MathMagic 8, l’editor di equazioni ora supporta anche iBooks Author
- Deskovery: finestre ''liquide'', ma anche sempre in ordine, oggi in sconto
- Trine: gioco fantasy e azione per Mac a soli 79 centesimi
- Televideo: tutte le informazioni e le pagine del Televideo su Mac senza attese
- SubRosaSoft, disponibili le versioni 7.5 delle utility per il recupero di file
- Timing: misura in automatico come e dove spendiamo il nostro tempo al Mac
