Forse più utile agli utenti Windows che a quelli Mac, comunque l’iPod Software Update 2.0.1 è online per scaricarlo (30,2 MB).
La maggiore novità è il supporto di USB 2 per Windows ma anche altri miglioramenti nel campo Mac: miglior supporto per le lingue asiatiche, miglior gestione delle playlist on-the-go, supporto dei file MP3 VBR, miglior illuminazione del display e funzione sveglia.
Viene corretto un problema riguardante i segnali desto e sinistro in ascolto.
Col comando Restore è possibile vuotare il disco prima di scaricare nuovo software.
Il software 2.0.1 funziona solo con gli iPod recentemente presentati, ovvero quelli con il dock e i pulsanti singoli sotto al display.